Vào lúc 05:30 ngày 2 tháng 4 theo giờ địa phương, một nhóm tay súng bịt mặt đã bất ngờ tấn công trường từ một thánh đường Hồi giáo gần đó. Chúng sử dụng súng AK-47 và dây lưng gắn thuốc nổ. Đã xảy ra một cuộc đụng độ giữa các tay súng và các nhân viên bảo vệ của trường đại học.[3][4] Chúng đã giết 2 bảo vệ của trường và sau đó tấn công vào các khu ký túc xá, nổ súng vào nhóm sinh viên tới hành lễ cầu nguyện buổi sáng tại một thánh đường trong khuôn viên nhà trường[5]. Lực lượng Quốc phòng Kenya và các cơ quan an ninh khác đã được triển khai,[6] bao vây phong tỏa trường học để ngăn những kẻ tấn công trốn thoát. Ba trong số bốn ký túc xá đã được sơ tán.[1]

Cuộc tấn công kết thúc sau gần 15 giờ đồng hồ[1]. Các tay súng đã bị giết lúc hoàng hôn.[4] Trong số 147 nạn nhân thiệt mạng thì đa số họ điều là sinh viên, các nạn nhân khác gồm 2 nhân viên bảo vệ, 1 người lính và 1 cảnh sát cũng bị thiệt mạng.[4] Khoảng 587 sinh viên trốn thoát, nhưng 79 người bị thương.[3]